ในโครงการแยกพิเศษ เทคโนโลยีเมมเบรนบำบัดน้ำส่วนใหญ่จะใช้สำหรับความเข้มข้นของวัสดุ การบำบัดน้ำเสียด้วยสีย้อม และการแยกโปรตีนในชีวเภสัชภัณฑ์ เทคโนโลยีเมมเบรนกรองนาโนและเทคโนโลยีอิเล็กโทรไดอะไลซิสมีบทบาทในการแยกแบบเลือกสรรในด้านต่างๆ เหล่านี้ เช่น นาโนฟิลเตรชันสำหรับการแยกสารที่มีความแตกต่างของน้ำหนักโมเลกุล และอิเล็กโทรไดอะไลซิสเพื่อจัดการกับการนำกรดและด่างกลับมาใช้ใหม่ การทำบริสุทธิ์ขั้นปลายในชีวเภสัชภัณฑ์ต้องใช้การกรองแบบอัลตราฟิลเตรชันและการกรองแบบไมโครฟิลเตรชันเพื่อกำจัดไวรัสหรือเศษเซลล์เพื่อให้มั่นใจในความบริสุทธิ์และความปลอดภัยของผลิตภัณฑ์